Czy można osobno numerować maile i zadania?

Tak, istnieje możliwość ustawienia osobnej numeracji dla maili i zadań.
Aby to zrobić należy: 

1. wejść w Ustawienia -> Konfiguracja Helpdesku
2. w polu "Współdzielenie numeracji" wybrać opcję "Osobna numeracja emaili i zadań" i kliknąć "Zapisz"

Od tego momentu wszystkie maile przychodzące oraz zadania będą numerowane osobno. 
Format numeracji jest jeden niezależnie od zaznaczonej opcji w polu "Współdzielenie numeracji".